BOSS 8： 库巴
    战斗要点：大库巴背着个小库巴，当你攻击大库巴以后它就会马上反击，尽管这样也只有上，在小库巴敲大库巴过来时，可以用锤子反击，如果胜利了就能和小库巴战斗，最好能尽快把小库巴干掉，因为小库巴会给大库巴加血，是比较麻烦的。
经过一段情节后，来到了外星女王的飞碟。根据以往的经验，一直前进，来到一个昏暗的场景中，顶击机关后，但是机关会移动到另外的地方，这时需要控制宝宝们到上面去打开电灯，才能找到机关。多顶几次，道路便打开了。坐电梯来到上部，终于又找到了公主，但是主角们却被众多敌人包围了。原来那个被蘑菇粘住脸的公主是女王假扮的。害得我们跟着她转了半天，真可恶！剧情后来到飞碟中枢，新闻记者用钥匙插进了系统，然而结果却与大家想的完全不一样，不仅没有切断敌人的能源，反而开启了众人脚下的陷阱。

    马里奥们掉落了废墟镇，让小马兄弟到右边的房子顶上，进入右边的场景后，再往下来到彩色机关处，再控制大马兄弟往下来到对面，顶击机关，便可将铁们开启。然后大家向着星星山脉进发。在地图最下面的左边能回到城堡的下水道，从蓝色管道即可来到星星山脉。这里比较简单，在记录点后会发生剧情，遇见敌人大部队。之后便会进入BOSS战。

BOSS 9： 炸弹搬运工
    战斗要点：这场种牛痘需要注意的是，最好不要打死第一个人，否则炸弹会向玩家滚过来，当全部干掉，只剩下最前面的那个敌人后，炸弹便会把敌人的司令炸过来，之后就可以一阵乱打，怎么爽怎么打。

    在山顶得知了，只要把碎片全部收齐了才能最终取得胜利，并且得知在宫殿内部有1个碎片。来到宫殿大门口，路易接受了试验，需要把顶部的发光方块取回来才允许他进入宫殿。顺利来到最上方，先让小马兄弟从左边弹上去，对着马里奥旋转升上来的方块吐水，然后再到右边高台上将方块顶下。在剧情中，路易由于选错了答案，还是没有得到星星门的允许，而路易也被打击得不轻。后来由于马里奥的建议，星星门才应可了这对好搭档。继续前进，在一个场景中需要将5个角落的方块顶下，出现光线，最终连成一个五角星，当顶了一个方块后，只有连着的线才不会消失。继续前进，来到右上房间，宝宝被压扁进去后，按照外面的机关出现的颜色顺序，需要用相应颜色的人来顶击，于是星星方块出现。在左下房间中，用以前学会的照亮方法，顺利将星星方块顶了下来。星星出现后，从中间的管道即可来到宫殿。

    第4个碎片终于到手了，剧情过后，大家继续深入，途中的机关需要压扁宝宝们来打开机关。来到大厅，发现记者等人都已经倒在了地上。利用下屏擦掉画上泥后，让人意外的事发生了，在画上画着另外一个女王。又是一阵地震，敌人出现，记者等人都被变成了紫蘑菇。没办法，又是一场不可避免的战斗。

BOSS 10：头上带刺的怪物
    战斗要点：人如其名，头上有刺显然不能用跳跃攻击，只能用锤子了。BOSS有一招困住众人的招式，这时要按AB键摆脱。当它受了一顶伤害后，便会扔出刺球，打回即可将BOSS打倒在地。战斗后期，BOSS会巨大化，虽然变大了，但是还是照样打。至于飞碟可以用BOSS的铁球攻击，飞碟的倒计时如果减为0，就会挂了，一定要注意。

    打败BOSS后又拿到了一个碎片，往上进入隧道回到现在的蘑菇王国，见过博士后去3楼的隧道，回到过去的蘑菇王国。进入内部，左上方有个雕像，用以前同样的方法给宝宝们照明。右边，钻地进入后打开机关，继续前进。来到和沙漠那关差不多的迷题的地方，当顺利开了4个光柱后，中间就会出现机关，送宝宝们上去顶击，再进入管道，来到2楼，之后来到敌人的飞船，大家在商议过后，准备控制这艘飞船，顶击紫色方块后，会出现很多方块，4人一人控制一个，除大马外的其他3人都是控制的上升，大马控制的是发射，打下所有飞船后来到右上有两个蓝色管道的场景，最右边那个是返回城堡，另一个则是进入下一个场景。一路前进，来到下面，把小马兄弟压扁后上去，打开机关，而大马兄弟来到一个平台顶机关，这样宝宝们就能打开另一个机关了。之后，四人顶彩色开关后，道路便打开了。在雕像里面的大屏幕上，大家看见了碧奇公主，从公主口中得知她被困在了顶楼。

    在下水道中，来到一个有齿轮的场景，先压扁宝宝后进入小洞，然后外面转动齿轮，小马们弹到上面，打开开关会即可汇合，再送小马们进入旋风加大威力，来到下方顶击机关，之后过桥，小马们进入树洞，大马变球进入大炮筒，小马门打击大炮，便将大马们射了出去，之后控制大马兄弟顶击管道，众人汇合后，再把宝宝们送到右边，然后顺序顶击彩色机关，进入下一个场景。宝宝们通过水管，放下吊桥，继续前进，在针刺处顶下机关，再次放下吊桥。开关被狗狗吞了后，要顶击两个方块来攻击那只狗，上屏显示有4个方块的位置。在后一次狗狗会从5个管道里把头伸出，只要攻击牙齿动得最快的那个即可。针刺地带消失后，通过过道来到城堡里面。

    右边有一个被防护罩包围住的蓝色管道，顶击机关，门打开了，上面密道也出现了。让小马兄弟们进入里面，打开机关，开启铁门，然后利用4人打开彩色机关，防护罩消失，进入管道，来到中部后，发生剧情，之后继续前进，来到大门前，记录后进入。这次终于见到了真正的公主，大家都开心得不得了。，然而公主正要告诉马里奥什么秘密时，又发生了事件。进入右边的电梯，控制脑袋与敌人进行战斗，胜利后，回到顶部，发现公主已经真正得到解放了。来到飞船旁，女王突然出现，战斗开始了。