在很久很久以前的一个遥远的空间里，有一颗暗黑星球，这个星球上存在着各种怪物，他们在宇宙空间里寻找着新的地方作为自己的家园，想着一切方法去占领它们。这次，他们看上了一个美丽的星球，也同时向这个星球上的蘑菇王国伸出了魔手。

    在过去的蘑菇王国的蘑菇城内，小马里奥和小路易来找小碧奇公主玩，与大臣说完话后，直向上走就能来到小碧奇的大殿（这个时机可以熟悉一下操作方法）。谁知小碧奇却被小库巴抓住了，并且还吐火打晕了前来救助的大臣，没办法，小马里奥也只硬着头皮上了。作为游戏的第一场战斗，完全就是教学，第一回合结束后，大臣会醒过来进行战斗说明，不想看的可以选NO，但是如果是第一次玩的话，教学讲解都推荐看一下，对游戏有较大帮助。打败小库巴后，蘑菇王国便遭到了强烈的攻击。

    画面一转，来到了现在的蘑菇王国。GADD博士发明了一个时空机器，而测试实验将在蘑菇王国内进行，我们可爱的碧奇公主将亲自参与这次实验，实验的目的就是回到过去的蘑菇王国，于是实验开始了。公主被顺利的送到了过去的蘑菇王国，但是。。。。。她并没有在约定的时间内回来，这让大家急得团团转，大臣甚至晕倒在地。控制马里奥来到地图上标有绿蘑菇的地方（写有S的书是存档点的标记），取得蘑菇，再回到大厅，当然了，有兴趣的玩家也可以到处逛逛，能拿到很多蘑菇和金币哦。把大臣救醒后时空机器也来到了众人面前，大家都前去迎接公主的归来，然而，出人意料的事情发生了，从里面出来的不是碧奇公主，而是一个丑陋又可怕的怪物，大家都被吓住了，小马哥与怪物打了起来，战斗结束后升到第2级。（在这里我说明一下加点数的情况，除了每个人物在升级后系统会自动加的点数外，还会有一个自己加的机会，大家可以在“HP、POW、DEF、SPEED和HIGE”中任意选择一种加，而加点的的多少也是采用近似***的方法来进行的。）发现公主并没有回来，大家正在商议之时，路易跑来告诉大家，中庭出现了一个奇怪的洞穴，于是众人来到中庭。原来这个奇怪的洞穴就是时空隧道，通过这个隧道能去到和公主一样的地方，但是并不知道能到达的具体地点，而回来的方法也不能很好的解决，路易非常兴奋，当他站在洞穴旁边仔细观察时，却被突然冒出来的大臣撞了下去，没办法，马里奥也只能跟着跳了进去。

    在剧情中学会了基本的菜单操作方法，而在前进途中皮箱也会经常跳出来讲解一些基本的操作。来到第3个场景后，马里奥被从天上掉下来的蘑菇人踩晕，从而得知村落遭到攻击。继续前行来到村子（本游戏采用了可见是遇敌，而如果是通过踩怪物进入战斗的话，就会是先制攻击），村子已经被攻击得不成样子了，在一个房子里见到了村长被卡在了烟囱里，交谈后把他顶出来，谁知刚落地就被一群紫蘑菇抓住了，而马里奥兄弟也寡不敌众，被飞碟打翻在地。小马里奥一行人坐在小库巴的飞船上逃跑，但同样也受到了猛烈的攻击，大家到大甲板后，发动了大炮打下了很多飞碟，但是却由于小库巴的疏忽，飞船掉到了村子附近，小马里奥兄弟前去救出了马里奥兄弟。随后在SHROOB女王的攻击下，也还算顺利的降落到了库巴城，但是大家却失散了。在前进中马里奥兄弟与小马里奥兄弟汇合了，然后开始4人一起行动。在随后的一个版面中，需要将小马里奥兄弟扔到台子上，然后去顶绿色管道，继续前进存档后会进入4人状态的战斗教学，进入蓝色管道后来到第2版，在第2个场景中先把小马里奥兄弟扔到高台上触动机关，道路接通后返回，4人继续前进，第3场景中出现的彩色方块，需要用不同的人先后顶击才能顺利完成（推荐进行教学说明）。来到第4场景,发现中间的门紧紧关着，在恩左上角有个大的红色“M”方块，先把小马里奥兄弟扔到上面，进去后发现看不见道路，现在控制马里奥去顶大“M”方块，再用小马里奥顶出现的小方块，这样道路就能被照亮，之后重复几次，顺利过关，然后再顶击中间带“？”的箱子，获得闪光宝石碎片，而门也打开了，4人集合后，继续前进。来到最深处，终于找到了时空时空隧道，回到了现代蘑菇王国。

    见到博士后，众人商议如何救出公主，马里奥拿出刚到手的闪光碎片，见到碎片的怪物被吓得发抖，于是博士认为宝石的力量可能会帮助他们打败怪物，救出公主，而这时碎片也替众人打开了继续前进的道路，在补充了装备和道具后，就可以向下一步前进了。来到森林，这里的树桩有洞，可以让小马们下去调查。来到一个很多水晶方块的房间，先让小马们进树洞，把里面所有火球都顶出来，然后再用大马兄弟顶外面的火球，当全部聚集当中间后，再顶大火球，就能打开上方被树木挡住的路，进入蓝色管道后发现工厂大门关着，没办法，往右来到漂浮方块房间，树洞里有控制方块移动的机关，箭头指的什么方向就能让外面的方块往什么方向移动。向右移动在第2个转弯处停下，向上走就能进入下一个场景。先跳起扔小马，顶击中间的彩色方块，之后以“YXBA”的顺利按键，这样工厂大门就开了一半了。继续前进，移动到右边触动机关，跳上高台之后用和刚才同样的方法把大门的另一半也打开，回去的路上是一个地上全是针刺的房间，利用机关控制方块的移动，出口在右下，但是这个房间有很多东西，大家可以逛一下，拿完道具后就可以进入工厂内部了。

    刚一进入工厂，大马兄弟就被吸进了鼻孔里，被抓走了，留下了小马兄弟与两个乌龟战斗。 
BOSS 1： 疯狂乌龟X2 
    战斗要点：乌龟的攻击并不难躲，需要注意的一点是，如果发现乌龟在举起锤子的时候，榔头掉了，那么就千万不要跳起来，跳起来反而会被打中。在干掉了一只乌龟后，他的攻击方式会有所变化，会连续丢锤子砸人，次数从2到5不等，但是也还算比较好打。

    战斗结束后，两只乌龟清醒了过来，并送给了小马兄弟锤子，随后进入教学模式。练习完毕后，两个小家伙就要开始继续冒险了，踩黄色机关打开门后进入，利用锤子顺利来到地图左上的房间。这个房间主要是要打开两个红色的按纽才能顺利过关，先爬上墙，顺着墙走，能打开第一个，而从墙上跳到另一边，就能打开第2个按纽。当来到有棵大树的房间的时候，就把那些给大树提供能量的宝珠用锤子砸破，这样就能救出大马兄弟。把小马兄弟扔到高台上，打开红色机关，门开了，之后变可以进入蓝色管道，来到第2层。在第1个场景中让小马兄弟进门去打开门的机关。来到一个长长的房间后，发现有两个门是关着，而且右边的路也被挡着，还好有个高台，把小马兄弟扔上去进入里面打开机关，下面挡路的激光消失了，大马兄弟向右走，顶开一个彩色方块机关后，上面出现一条路，再控制小马兄弟，钻地进门后打开第2个机关，再控制大马兄弟走到彩色方块下方，小马兄弟继续向右走，先顶了彩色方块再迅速切换到大马兄弟接着顶，然后控制小马兄弟出来，但是先不要跳下台来，在台上跟着向左走，可以打开两个机关，从而打开下面两个门。4人集合后，先进入左边的门，能玩一个顶金币的MINI游戏。返回进入右边的门，来到浮空方块的房间，先用小马兄弟去控制方块移动，向右移动，用大马兄弟顶红色“！”的方块，上面出现道路，再向右移动到尽头，让大马兄弟顶击彩色方块，上面再次出现道路，让小马兄弟从右边出来，存档后就是BOSS战了。 BOSS 2： 毛毛虫
    战斗要点：毛毛虫的招式比较多，身体一般呈红色，在红色状态下遭受的话，会发动全体攻击，地震波浪，及时躲避不算难。而他旁边的杂兵才是攻击它的主要媒介。那些杂兵会拿出蘑菇或者毒药在手上，如果把蘑菇打到毛毛虫的杯子中被它喝掉，那它便会回复大量HP，如果把毒药打到了杯子里被它喝掉，那么它就会变成虚弱状态，攻击的最佳时机就到了。
打败毛毛虫后，得到闪光碎片2，不过马上就被小库巴抢走了。回到现代与博士对话，得知现在蘑菇城里出现了很多时空隧道，来到中庭，看见小公主在大哭，而两个大臣在千方百计的逗公主笑，使出了浑身解数才把公主逗笑，而大马兄弟却让大臣教他们使用这招，学会了回转后到从2楼图书馆进入时空隧道。

    画面一转来到了过去的耀西岛,在第2个场景的一个房间会遇到新闻记者,记者发现这里一个人影都没有，而由于大人们的体重过大，那个弹簧根本就弹不起来，那当然该小马兄弟上场了，弹上去后发现上面躲着很多耀西，大家都怕得发抖，这时，突然传来了巨大的脚步声，大家都跑开了，出来一看，原来是只巨大的恐龙，而随后也把所有的耀西全都吃进肚子里了。恐龙走后，在另外一个房子里找到了巫师。一直跟着巫师向前走，进入蓝色管道后，发生巫师点燃火焰的情节，之后让小马去上面水源处喝水，从而学会新的技能，喝水后按Y就能将水吐出来，扑灭火焰，继续前进，在云层上有个水源，喝水后对着云层上的机器吐，下面的火焰就灭了，然后去顶一下上面的方块，就可以继续前进了，来到有两个火焰的场景，在左上的铁栅栏处控制小马兄弟进去，喝水后对着通向外面的管道吐水，灭火后让大马兄弟利用回转到高台上去顶击绿色的方块，在右上的场景里，需要先调整管道的位置，对准火焰后，让小马兄弟上天去吐水。通过蓝色方块，进入蓝色管道。在第2场景中需要把大马和小马分开，大马利用旋风过去，而小马利用云层就能通过。下一个场景先让大马兄弟去顶击紫色方块，然后小马兄弟进入栅栏。出来后就有个水源，喝水后到右边把火熄灭，进洞后看见小库巴。小马兄弟趁小库巴在炫耀碎片之时，把他的饼干全都吃完了，巫师让库巴先跑了，自己殿后，于是，战斗开始了。

BOSS 3： 坐着扫帚的巫师
    战斗要点：巫师分身后，只有对真身进行攻击它才会伤血，另外如果把刺球打回去他就会直接费血。一段时间后，他会落地发出火焰只要躲避后就会烧到他自己，然后他会进行冲撞。

    干掉巫师后，前行就会遇见库巴，当大家正在抢夺碎片的时候，却被大恐龙吃进了肚子里。宝宝们弹上去后看见有个耀西在推石头，然而却推不动，现在需要把所有的耀西找来帮忙。这里有5个房间，其中中间的房间是存档用的，我们按从左到右的顺序来一个一个来救耀西，第1个房间中只要打败一个坏蘑菇即可救出，第2个房间，用小马的锤子把墙上的机关打成“蓝、黄”色，然后进入栅栏内，将墙上的所有机关打成和下方牢门上的珠子颜，色一致就能将门打开，然后将蓝耀西救出。右上的房间中只需将小马兄弟弹到上面，掉进中间的坑，敲打墙上的机关即可。最右边的房间控制小马兄弟进去喝水后对着飞碟吐中2次即可破坏飞碟，然后再进去消灭坏蘑菇即可。而最后一个耀西就在中央大厅，先到树洞里取得果实，再出来给躺在地上的耀西吃了后便可。所有耀西的偶救出后，石头也顺利被推动，出去的道路也就被打开了，跟着大家跳下去。

    通过蓝色管道后，看见耀西们都被抓住做成了蛋,下一个场景中需要用大马兄弟把蛋顶上去后用小马兄弟吐水,将蛋大破，两只耀西都被救出后，石头又被推开了，继续前进，在踩下蓝色机关后，见到了公主的跟班，但是他已经失去了记忆，唯一有的就是身上带着的画，非常清楚的画着公主与外星女王达到样子，一路上来，遇见BOSS。

BOSS 4： 貌似青蛙的怪物
    战斗要点：这个BOSS比较简单，只要先攻击蛋，救出5个耀西，那他们就会把石头推下来将BOSS砸翻在地，这时就可以狠狠的攻击BOSS了。耀西岛，马里奥兄弟夺回了两个闪光碎片，同时也得到耀西们的谢意。

    回到现代的蘑菇王国，见了博士后，在中庭学会了变球技能，然后在左上方去变球当齿轮，打开下水道开关，进入下水道后发现有个可疑的红衣人，追踪着来到下水管道里，发现他在里面开了个商店，以后就可以用收集来的豌豆来换饰品了。然后返回蘑菇王国2楼，来到中间的螺旋楼梯，利用变球能力，在限定时间内来到顶层顶击机关，即可把门打开，然后进入隧道，来到过去的沙漠。在第2个场景中踩下蓝色机关，进入堡垒里，却发现这里在紫蘑菇的大本营。。。。大家在逃走的途中遇见了新闻记者，得知外星女王即将来到这里。这时堡垒的大门已经紧闭了，要想打开它就必须将4个雕像下的机关都顶击一下，4个雕像是两两相对的，当你顶了一个后，另一个就会出现时间限制提示，所以，最好的方法就是把小马和大马分开，一边站一对，再顶击，这样就可以了。当中间的蓝色机关冰块溶解后，顶击就可从堡垒上方进入内部。

    来到堡垒内部，而这时，紫蘑菇们正在举行欢迎仪式，欢迎外星女王的到来，而我们的碧奇公主却被丢进了巨大食人花的嘴里。。。先往右边走，这里有个金块MINI游戏，里面的地道也有很多东西，拿光后来到左边，顶开机关后让大马兄弟变成球往前开路，来到下方后顶击管道，4人汇合。在大门右边有个台阶，把小马兄弟扔上去，大马兄弟顶击大方块为小马兄弟照明，顺利走出来后，用锤子打开机关，大门就开了。进去后便来到了会场中间，没办法了，一阵胡闹之后便开始了BOSS战。

BOSS 5： 蓝色坏蘑菇
    战斗要点：这个BOSS就只有两种攻击方式，一个是扔棒棒糖，另一个是吐火球或者蘑菇，不管是哪一种攻击方式都推荐两个键一起按，虽然上屏会显示提示，但是到了后面根本看不过来，并且顺序也有可能不一样。

    干掉BOSS之后，谁知外星女王却使用人海战术将马里奥兄弟打入了地下，在一段暴笑的剧情之后，冒险继续。消灭火焰后，用锤子砸墙，里面能补充道具，而左边的蓝色管道能回到沙漠，我们也不用去，而是应该以下面的蓝色管道为目标出发。一些菱形的断桥可以变球后滚过去，没走多远就看见了新闻记者也被食人花吞进了肚子。来到齿轮机关处，需要将大马兄弟不停的在齿轮处转着，而小马兄弟在上方用水吐，当吐中上面和下面的一样的移动道具时，才算正确，成功3次后道路开启。进入蓝色管道，发现路被堵了，控制小马兄弟到上面去往右走，顶击方块后，控制大马兄弟在限定时间内滚过去顶击出现的紫色方块，来到下一个齿轮的场景后，大马兄弟转动齿轮可以让上面的石板移动，这时需控制宝宝们去顶方块，当3个方块全都顶了后，道路就会出现了。一路前进，终于来到了食人花的房间，当顶了中间的金币后，食人花出现。

BOSS 6： 巨大食人花
    战斗要点：它飞在空中时用跳跃攻击，当它钻地里时用锤子攻击，而它在攻击时，我们需要不停的条，否则会被吸进地嘴里，总的来说很简单。

    干掉BOSS后，得到了一个碎片，也救出了新闻记者，往里走，终于找到了我们可爱的碧奇公主，可谁知。公主的脸被紫蘑菇粘住了。随后大家回到了现在的蘑菇王国，剧情后来到中庭，这次能学会两个新技能哦~谁知小公主被风吹到了上面的小洞里，利用刚才学会的两个技能就能把小公主救出来。向上走，发生了地震，急忙来到2楼公主的房间，发生剧情，然后来到1楼左上，在高台上面把宝宝们用旋风送到右边，进入隧道。第2个场景中利用旋风送宝宝到上面顶开机关，而那个金币只要将宝宝压扁了就能上去取得。在倒数第2个场景，把宝宝压扁了让他们进入小洞里，一路向上看见机关后，用锤子将它敲下，这用大马顶就能不门打开。

    在针刺地带，先用旋风把宝宝送过去，然后大马再自己转过去。在第5个场景中，需要先把宝宝压扁，再用大马旋转外面的齿轮，这样里面的风扇才会吹出更大的风，在上面的云层有个紫色方块，顶击即可打开前进道路，来到下一个场景。利用各种技能取完道具后，进入蓝色管道，来到火山口。发现了公主的王冠，谁知突然火山喷发了，大家跑到右下的研究所，遇见了年轻的博士，大家都在告诉他火山暴发的事，可是他忙着搞实验，根本不理大家，就在这时，火山陨石砸了进来，顿时实验所就燃起了熊熊大火，博士让马里奥兄弟去救火，先用旋风把水闸打开，再用宝宝喝水灭火，剧情后火山口的火已灭，回到山顶，与两块石头战斗。

BOSS 7： 石头怪
    战斗要点：BOSS在战斗一段时间后会分身，出现4个小石头怪，这时要注意的是，真身是两个牙齿一模一样的其中一个，锁定那两个打就行了。
    剧情过后来到了火山内部，针刺地带需要用旋风把宝宝们送飞起来，到旋风上加大力度，之后顺着金币的路线，安全着地。来到一个有大炮的房间，不宝宝压扁了进入左边的小洞，发生***剧情后，控制大马兄弟变球进入炮筒。***如果中了3个星星就能得到一个豌豆。之后坐上灰石头，掉到下一层。先到右边拿金币，然后向左走，然后会遇见以前那种用小马兄弟控制砖块方向的迷题，往左下走是一些道具，右下是前进的路，之后又是利用滑翔技能的地方，然后再坐着石头掉到下一层。往右进行MINI游戏，必须取得30个以上的钻石才能过关，然后回到灰石头处下到最下层，便是与库巴之战了。 BOSS 8： 库巴
    战斗要点：大库巴背着个小库巴，当你攻击大库巴以后它就会马上反击，尽管这样也只有上，在小库巴敲大库巴过来时，可以用锤子反击，如果胜利了就能和小库巴战斗，最好能尽快把小库巴干掉，因为小库巴会给大库巴加血，是比较麻烦的。
经过一段情节后，来到了外星女王的飞碟。根据以往的经验，一直前进，来到一个昏暗的场景中，顶击机关后，但是机关会移动到另外的地方，这时需要控制宝宝们到上面去打开电灯，才能找到机关。多顶几次，道路便打开了。坐电梯来到上部，终于又找到了公主，但是主角们却被众多敌人包围了。原来那个被蘑菇粘住脸的公主是女王假扮的。害得我们跟着她转了半天，真可恶！剧情后来到飞碟中枢，新闻记者用钥匙插进了系统，然而结果却与大家想的完全不一样，不仅没有切断敌人的能源，反而开启了众人脚下的陷阱。

    马里奥们掉落了废墟镇，让小马兄弟到右边的房子顶上，进入右边的场景后，再往下来到彩色机关处，再控制大马兄弟往下来到对面，顶击机关，便可将铁们开启。然后大家向着星星山脉进发。在地图最下面的左边能回到城堡的下水道，从蓝色管道即可来到星星山脉。这里比较简单，在记录点后会发生剧情，遇见敌人大部队。之后便会进入BOSS战。

BOSS 9： 炸弹搬运工
    战斗要点：这场种牛痘需要注意的是，最好不要打死第一个人，否则炸弹会向玩家滚过来，当全部干掉，只剩下最前面的那个敌人后，炸弹便会把敌人的司令炸过来，之后就可以一阵乱打，怎么爽怎么打。

    在山顶得知了，只要把碎片全部收齐了才能最终取得胜利，并且得知在宫殿内部有1个碎片。来到宫殿大门口，路易接受了试验，需要把顶部的发光方块取回来才允许他进入宫殿。顺利来到最上方，先让小马兄弟从左边弹上去，对着马里奥旋转升上来的方块吐水，然后再到右边高台上将方块顶下。在剧情中，路易由于选错了答案，还是没有得到星星门的允许，而路易也被打击得不轻。后来由于马里奥的建议，星星门才应可了这对好搭档。继续前进，在一个场景中需要将5个角落的方块顶下，出现光线，最终连成一个五角星，当顶了一个方块后，只有连着的线才不会消失。继续前进，来到右上房间，宝宝被压扁进去后，按照外面的机关出现的颜色顺序，需要用相应颜色的人来顶击，于是星星方块出现。在左下房间中，用以前学会的照亮方法，顺利将星星方块顶了下来。星星出现后，从中间的管道即可来到宫殿。

    第4个碎片终于到手了，剧情过后，大家继续深入，途中的机关需要压扁宝宝们来打开机关。来到大厅，发现记者等人都已经倒在了地上。利用下屏擦掉画上泥后，让人意外的事发生了，在画上画着另外一个女王。又是一阵地震，敌人出现，记者等人都被变成了紫蘑菇。没办法，又是一场不可避免的战斗。

BOSS 10：头上带刺的怪物
    战斗要点：人如其名，头上有刺显然不能用跳跃攻击，只能用锤子了。BOSS有一招困住众人的招式，这时要按AB键摆脱。当它受了一顶伤害后，便会扔出刺球，打回即可将BOSS打倒在地。战斗后期，BOSS会巨大化，虽然变大了，但是还是照样打。至于飞碟可以用BOSS的铁球攻击，飞碟的倒计时如果减为0，就会挂了，一定要注意。

    打败BOSS后又拿到了一个碎片，往上进入隧道回到现在的蘑菇王国，见过博士后去3楼的隧道，回到过去的蘑菇王国。进入内部，左上方有个雕像，用以前同样的方法给宝宝们照明。右边，钻地进入后打开机关，继续前进。来到和沙漠那关差不多的迷题的地方，当顺利开了4个光柱后，中间就会出现机关，送宝宝们上去顶击，再进入管道，来到2楼，之后来到敌人的飞船，大家在商议过后，准备控制这艘飞船，顶击紫色方块后，会出现很多方块，4人一人控制一个，除大马外的其他3人都是控制的上升，大马控制的是发射，打下所有飞船后来到右上有两个蓝色管道的场景，最右边那个是返回城堡，另一个则是进入下一个场景。一路前进，来到下面，把小马兄弟压扁后上去，打开机关，而大马兄弟来到一个平台顶机关，这样宝宝们就能打开另一个机关了。之后，四人顶彩色开关后，道路便打开了。在雕像里面的大屏幕上，大家看见了碧奇公主，从公主口中得知她被困在了顶楼。

    在下水道中，来到一个有齿轮的场景，先压扁宝宝后进入小洞，然后外面转动齿轮，小马们弹到上面，打开开关会即可汇合，再送小马们进入旋风加大威力，来到下方顶击机关，之后过桥，小马们进入树洞，大马变球进入大炮筒，小马门打击大炮，便将大马们射了出去，之后控制大马兄弟顶击管道，众人汇合后，再把宝宝们送到右边，然后顺序顶击彩色机关，进入下一个场景。宝宝们通过水管，放下吊桥，继续前进，在针刺处顶下机关，再次放下吊桥。开关被狗狗吞了后，要顶击两个方块来攻击那只狗，上屏显示有4个方块的位置。在后一次狗狗会从5个管道里把头伸出，只要攻击牙齿动得最快的那个即可。针刺地带消失后，通过过道来到城堡里面。

    右边有一个被防护罩包围住的蓝色管道，顶击机关，门打开了，上面密道也出现了。让小马兄弟们进入里面，打开机关，开启铁门，然后利用4人打开彩色机关，防护罩消失，进入管道，来到中部后，发生剧情，之后继续前进，来到大门前，记录后进入。这次终于见到了真正的公主，大家都开心得不得了。，然而公主正要告诉马里奥什么秘密时，又发生了事件。进入右边的电梯，控制脑袋与敌人进行战斗，胜利后，回到顶部，发现公主已经真正得到解放了。来到飞船旁，女王突然出现，战斗开始了。 BOSS 11：外星女王·妹 
    战斗要点：其实感觉并不难打，在有人被锁定后需要先跳跃再用锤子攻击，将防护罩打破后才能攻击到她的本体。

    战斗结束后，公主正在对马里奥说明事实真相时，小库巴突然出现，抢走了关键道具，但是却被女王变成了紫蘑菇，而这个女王却是那个女王的姐姐。谁也没想到，碎片收集完以后的结果却是让女王·姐复活了。没关系，复活了就再干掉你吧！

BOSS 12：外星女王·姐
    战斗要点：姐姐的第1形态比较简单，只要把那些飞碟打散就没有什么危险。在第2形态中，需要先把她脚上的触手干掉，才能攻击她的头部，当她王冠的光芒淡下来后才能对她早成伤害，推荐使用火花进行攻击。

    战斗结束后，游戏也接近尾声了，所有的紫色蘑菇也因为博士的发明而恢复了原状。回到了现在，大家都夸奖了马里奥兄弟们，在最后一场战斗结束后，宝宝们也回到了过去，大家都分开了，但是这份情谊已经烙入了大家的心中。
BOSS 2： 毛毛虫
    战斗要点：毛毛虫的招式比较多，身体一般呈红色，在红色状态下遭受的话，会发动全体攻击，地震波浪，及时躲避不算难。而他旁边的杂兵才是攻击它的主要媒介。那些杂兵会拿出蘑菇或者毒药在手上，如果把蘑菇打到毛毛虫的杯子中被它喝掉，那它便会回复大量HP，如果把毒药打到了杯子里被它喝掉，那么它就会变成虚弱状态，攻击的最佳时机就到了。
打败毛毛虫后，得到闪光碎片2，不过马上就被小库巴抢走了。回到现代与博士对话，得知现在蘑菇城里出现了很多时空隧道，来到中庭，看见小公主在大哭，而两个大臣在千方百计的逗公主笑，使出了浑身解数才把公主逗笑，而大马兄弟却让大臣教他们使用这招，学会了回转后到从2楼图书馆进入时空隧道。

    画面一转来到了过去的耀西岛,在第2个场景的一个房间会遇到新闻记者,记者发现这里一个人影都没有，而由于大人们的体重过大，那个弹簧根本就弹不起来，那当然该小马兄弟上场了，弹上去后发现上面躲着很多耀西，大家都怕得发抖，这时，突然传来了巨大的脚步声，大家都跑开了，出来一看，原来是只巨大的恐龙，而随后也把所有的耀西全都吃进肚子里了。恐龙走后，在另外一个房子里找到了巫师。一直跟着巫师向前走，进入蓝色管道后，发生巫师点燃火焰的情节，之后让小马去上面水源处喝水，从而学会新的技能，喝水后按Y就能将水吐出来，扑灭火焰，继续前进，在云层上有个水源，喝水后对着云层上的机器吐，下面的火焰就灭了，然后去顶一下上面的方块，就可以继续前进了，来到有两个火焰的场景，在左上的铁栅栏处控制小马兄弟进去，喝水后对着通向外面的管道吐水，灭火后让大马兄弟利用回转到高台上去顶击绿色的方块，在右上的场景里，需要先调整管道的位置，对准火焰后，让小马兄弟上天去吐水。通过蓝色方块，进入蓝色管道。在第2场景中需要把大马和小马分开，大马利用旋风过去，而小马利用云层就能通过。下一个场景先让大马兄弟去顶击紫色方块，然后小马兄弟进入栅栏。出来后就有个水源，喝水后到右边把火熄灭，进洞后看见小库巴。小马兄弟趁小库巴在炫耀碎片之时，把他的饼干全都吃完了，巫师让库巴先跑了，自己殿后，于是，战斗开始了。

BOSS 3： 坐着扫帚的巫师
    战斗要点：巫师分身后，只有对真身进行攻击它才会伤血，另外如果把刺球打回去他就会直接费血。一段时间后，他会落地发出火焰只要躲避后就会烧到他自己，然后他会进行冲撞。

    干掉巫师后，前行就会遇见库巴，当大家正在抢夺碎片的时候，却被大恐龙吃进了肚子里。宝宝们弹上去后看见有个耀西在推石头，然而却推不动，现在需要把所有的耀西找来帮忙。这里有5个房间，其中中间的房间是存档用的，我们按从左到右的顺序来一个一个来救耀西，第1个房间中只要打败一个坏蘑菇即可救出，第2个房间，用小马的锤子把墙上的机关打成“蓝、黄”色，然后进入栅栏内，将墙上的所有机关打成和下方牢门上的珠子颜，色一致就能将门打开，然后将蓝耀西救出。右上的房间中只需将小马兄弟弹到上面，掉进中间的坑，敲打墙上的机关即可。最右边的房间控制小马兄弟进去喝水后对着飞碟吐中2次即可破坏飞碟，然后再进去消灭坏蘑菇即可。而最后一个耀西就在中央大厅，先到树洞里取得果实，再出来给躺在地上的耀西吃了后便可。所有耀西的偶救出后，石头也顺利被推动，出去的道路也就被打开了，跟着大家跳下去。

    通过蓝色管道后，看见耀西们都被抓住做成了蛋,下一个场景中需要用大马兄弟把蛋顶上去后用小马兄弟吐水,将蛋大破，两只耀西都被救出后，石头又被推开了，继续前进，在踩下蓝色机关后，见到了公主的跟班，但是他已经失去了记忆，唯一有的就是身上带着的画，非常清楚的画着公主与外星女王达到样子，一路上来，遇见BOSS。

BOSS 4： 貌似青蛙的怪物
    战斗要点：这个BOSS比较简单，只要先攻击蛋，救出5个耀西，那他们就会把石头推下来将BOSS砸翻在地，这时就可以狠狠的攻击BOSS了。耀西岛，马里奥兄弟夺回了两个闪光碎片，同时也得到耀西们的谢意。

    回到现代的蘑菇王国，见了博士后，在中庭学会了变球技能，然后在左上方去变球当齿轮，打开下水道开关，进入下水道后发现有个可疑的红衣人，追踪着来到下水管道里，发现他在里面开了个商店，以后就可以用收集来的豌豆来换饰品了。然后返回蘑菇王国2楼，来到中间的螺旋楼梯，利用变球能力，在限定时间内来到顶层顶击机关，即可把门打开，然后进入隧道，来到过去的沙漠。在第2个场景中踩下蓝色机关，进入堡垒里，却发现这里在紫蘑菇的大本营。。。。大家在逃走的途中遇见了新闻记者，得知外星女王即将来到这里。这时堡垒的大门已经紧闭了，要想打开它就必须将4个雕像下的机关都顶击一下，4个雕像是两两相对的，当你顶了一个后，另一个就会出现时间限制提示，所以，最好的方法就是把小马和大马分开，一边站一对，再顶击，这样就可以了。当中间的蓝色机关冰块溶解后，顶击就可从堡垒上方进入内部。

    来到堡垒内部，而这时，紫蘑菇们正在举行欢迎仪式，欢迎外星女王的到来，而我们的碧奇公主却被丢进了巨大食人花的嘴里。。。先往右边走，这里有个金块MINI游戏，里面的地道也有很多东西，拿光后来到左边，顶开机关后让大马兄弟变成球往前开路，来到下方后顶击管道，4人汇合。在大门右边有个台阶，把小马兄弟扔上去，大马兄弟顶击大方块为小马兄弟照明，顺利走出来后，用锤子打开机关，大门就开了。进去后便来到了会场中间，没办法了，一阵胡闹之后便开始了BOSS战。

BOSS 5： 蓝色坏蘑菇
    战斗要点：这个BOSS就只有两种攻击方式，一个是扔棒棒糖，另一个是吐火球或者蘑菇，不管是哪一种攻击方式都推荐两个键一起按，虽然上屏会显示提示，但是到了后面根本看不过来，并且顺序也有可能不一样。

    干掉BOSS之后，谁知外星女王却使用人海战术将马里奥兄弟打入了地下，在一段暴笑的剧情之后，冒险继续。消灭火焰后，用锤子砸墙，里面能补充道具，而左边的蓝色管道能回到沙漠，我们也不用去，而是应该以下面的蓝色管道为目标出发。一些菱形的断桥可以变球后滚过去，没走多远就看见了新闻记者也被食人花吞进了肚子。来到齿轮机关处，需要将大马兄弟不停的在齿轮处转着，而小马兄弟在上方用水吐，当吐中上面和下面的一样的移动道具时，才算正确，成功3次后道路开启。进入蓝色管道，发现路被堵了，控制小马兄弟到上面去往右走，顶击方块后，控制大马兄弟在限定时间内滚过去顶击出现的紫色方块，来到下一个齿轮的场景后，大马兄弟转动齿轮可以让上面的石板移动，这时需控制宝宝们去顶方块，当3个方块全都顶了后，道路就会出现了。一路前进，终于来到了食人花的房间，当顶了中间的金币后，食人花出现。

BOSS 6： 巨大食人花
    战斗要点：它飞在空中时用跳跃攻击，当它钻地里时用锤子攻击，而它在攻击时，我们需要不停的条，否则会被吸进地嘴里，总的来说很简单。

    干掉BOSS后，得到了一个碎片，也救出了新闻记者，往里走，终于找到了我们可爱的碧奇公主，可谁知。公主的脸被紫蘑菇粘住了。随后大家回到了现在的蘑菇王国，剧情后来到中庭，这次能学会两个新技能哦~谁知小公主被风吹到了上面的小洞里，利用刚才学会的两个技能就能把小公主救出来。向上走，发生了地震，急忙来到2楼公主的房间，发生剧情，然后来到1楼左上，在高台上面把宝宝们用旋风送到右边，进入隧道。第2个场景中利用旋风送宝宝到上面顶开机关，而那个金币只要将宝宝压扁了就能上去取得。在倒数第2个场景，把宝宝压扁了让他们进入小洞里，一路向上看见机关后，用锤子将它敲下，这用大马顶就能不门打开。

    在针刺地带，先用旋风把宝宝送过去，然后大马再自己转过去。在第5个场景中，需要先把宝宝压扁，再用大马旋转外面的齿轮，这样里面的风扇才会吹出更大的风，在上面的云层有个紫色方块，顶击即可打开前进道路，来到下一个场景。利用各种技能取完道具后，进入蓝色管道，来到火山口。发现了公主的王冠，谁知突然火山喷发了，大家跑到右下的研究所，遇见了年轻的博士，大家都在告诉他火山暴发的事，可是他忙着搞实验，根本不理大家，就在这时，火山陨石砸了进来，顿时实验所就燃起了熊熊大火，博士让马里奥兄弟去救火，先用旋风把水闸打开，再用宝宝喝水灭火，剧情后火山口的火已灭，回到山顶，与两块石头战斗。

BOSS 7： 石头怪
    战斗要点：BOSS在战斗一段时间后会分身，出现4个小石头怪，这时要注意的是，真身是两个牙齿一模一样的其中一个，锁定那两个打就行了。
    剧情过后来到了火山内部，针刺地带需要用旋风把宝宝们送飞起来，到旋风上加大力度，之后顺着金币的路线，安全着地。来到一个有大炮的房间，不宝宝压扁了进入左边的小洞，发生老虎机剧情后，控制大马兄弟变球进入炮筒。老虎机如果中了3个星星就能得到一个豌豆。之后坐上灰石头，掉到下一层。先到右边拿金币，然后向左走，然后会遇见以前那种用小马兄弟控制砖块方向的迷题，往左下走是一些道具，右下是前进的路，之后又是利用滑翔技能的地方，然后再坐着石头掉到下一层。往右进行MINI游戏，必须取得30个以上的钻石才能过关，然后回到灰石头处下到最下层，便是与库巴之战了。

BOSS 8： 库巴
    战斗要点：大库巴背着个小库巴，当你攻击大库巴以后它就会马上反击，尽管这样也只有上，在小库巴敲大库巴过来时，可以用锤子反击，如果胜利了就能和小库巴战斗，最好能尽快把小库巴干掉，因为小库巴会给大库巴加血，是比较麻烦的。
经过一段情节后，来到了外星女王的飞碟。根据以往的经验，一直前进，来到一个昏暗的场景中，顶击机关后，但是机关会移动到另外的地方，这时需要控制宝宝们到上面去打开电灯，才能找到机关。多顶几次，道路便打开了。坐电梯来到上部，终于又找到了公主，但是主角们却被众多敌人包围了。原来那个被蘑菇粘住脸的公主是女王假扮的。害得我们跟着她转了半天，真可恶！剧情后来到飞碟中枢，新闻记者用钥匙插进了系统，然而结果却与大家想的完全不一样，不仅没有切断敌人的能源，反而开启了众人脚下的陷阱。

    马里奥们掉落了废墟镇，让小马兄弟到右边的房子顶上，进入右边的场景后，再往下来到彩色机关处，再控制大马兄弟往下来到对面，顶击机关，便可将铁们开启。然后大家向着星星山脉进发。在地图最下面的左边能回到城堡的下水道，从蓝色管道即可来到星星山脉。这里比较简单，在记录点后会发生剧情，遇见敌人大部队。之后便会进入BOSS战。

BOSS 9： 炸弹搬运工
    战斗要点：这场种牛痘需要注意的是，最好不要打死第一个人，否则炸弹会向玩家滚过来，当全部干掉，只剩下最前面的那个敌人后，炸弹便会把敌人的司令炸过来，之后就可以一阵乱打，怎么爽怎么打。

    在山顶得知了，只要把碎片全部收齐了才能最终取得胜利，并且得知在宫殿内部有1个碎片。来到宫殿大门口，路易接受了试验，需要把顶部的发光方块取回来才允许他进入宫殿。顺利来到最上方，先让小马兄弟从左边弹上去，对着马里奥旋转升上来的方块吐水，然后再到右边高台上将方块顶下。在剧情中，路易由于选错了答案，还是没有得到星星门的允许，而路易也被打击得不轻。后来由于马里奥的建议，星星门才应可了这对好搭档。继续前进，在一个场景中需要将5个角落的方块顶下，出现光线，最终连成一个五角星，当顶了一个方块后，只有连着的线才不会消失。继续前进，来到右上房间，宝宝被压扁进去后，按照外面的机关出现的颜色顺序，需要用相应颜色的人来顶击，于是星星方块出现。在左下房间中，用以前学会的照亮方法，顺利将星星方块顶了下来。星星出现后，从中间的管道即可来到宫殿。

    第4个碎片终于到手了，剧情过后，大家继续深入，途中的机关需要压扁宝宝们来打开机关。来到大厅，发现记者等人都已经倒在了地上。利用下屏擦掉画上泥后，让人意外的事发生了，在画上画着另外一个女王。又是一阵地震，敌人出现，记者等人都被变成了紫蘑菇。没办法，又是一场不可避免的战斗。

BOSS 10：头上带刺的怪物
    战斗要点：人如其名，头上有刺显然不能用跳跃攻击，只能用锤子了。BOSS有一招困住众人的招式，这时要按AB键摆脱。当它受了一顶伤害后，便会扔出刺球，打回即可将BOSS打倒在地。战斗后期，BOSS会巨大化，虽然变大了，但是还是照样打。至于飞碟可以用BOSS的铁球攻击，飞碟的倒计时如果减为0，就会挂了，一定要注意。

    打败BOSS后又拿到了一个碎片，往上进入隧道回到现在的蘑菇王国，见过博士后去3楼的隧道，回到过去的蘑菇王国。进入内部，左上方有个雕像，用以前同样的方法给宝宝们照明。右边，钻地进入后打开机关，继续前进。来到和沙漠那关差不多的迷题的地方，当顺利开了4个光柱后，中间就会出现机关，送宝宝们上去顶击，再进入管道，来到2楼，之后来到敌人的飞船，大家在商议过后，准备控制这艘飞船，顶击紫色方块后，会出现很多方块，4人一人控制一个，除大马外的其他3人都是控制的上升，大马控制的是发射，打下所有飞船后来到右上有两个蓝色管道的场景，最右边那个是返回城堡，另一个则是进入下一个场景。一路前进，来到下面，把小马兄弟压扁后上去，打开机关，而大马兄弟来到一个平台顶机关，这样宝宝们就能打开另一个机关了。之后，四人顶彩色开关后，道路便打开了。在雕像里面的大屏幕上，大家看见了碧奇公主，从公主口中得知她被困在了顶楼。

    在下水道中，来到一个有齿轮的场景，先压扁宝宝后进入小洞，然后外面转动齿轮，小马们弹到上面，打开开关会即可汇合，再送小马们进入旋风加大威力，来到下方顶击机关，之后过桥，小马们进入树洞，大马变球进入大炮筒，小马门打击大炮，便将大马们射了出去，之后控制大马兄弟顶击管道，众人汇合后，再把宝宝们送到右边，然后顺序顶击彩色机关，进入下一个场景。宝宝们通过水管，放下吊桥，继续前进，在针刺处顶下机关，再次放下吊桥。开关被狗狗吞了后，要顶击两个方块来攻击那只狗，上屏显示有4个方块的位置。在后一次狗狗会从5个管道里把头伸出，只要攻击牙齿动得最快的那个即可。针刺地带消失后，通过过道来到城堡里面。

    右边有一个被防护罩包围住的蓝色管道，顶击机关，门打开了，上面密道也出现了。让小马兄弟们进入里面，打开机关，开启铁门，然后利用4人打开彩色机关，防护罩消失，进入管道，来到中部后，发生剧情，之后继续前进，来到大门前，记录后进入。这次终于见到了真正的公主，大家都开心得不得了。，然而公主正要告诉马里奥什么秘密时，又发生了事件。进入右边的电梯，控制脑袋与敌人进行战斗，胜利后，回到顶部，发现公主已经真正得到解放了。来到飞船旁，女王突然出现，战斗开始了。

BOSS 11：外星女王·妹 
    战斗要点：其实感觉并不难打，在有人被锁定后需要先跳跃再用锤子攻击，将防护罩打破后才能攻击到她的本体。

    战斗结束后，公主正在对马里奥说明事实真相时，小库巴突然出现，抢走了关键道具，但是却被女王变成了紫蘑菇，而这个女王却是那个女王的姐姐。谁也没想到，碎片收集完以后的结果却是让女王·姐复活了。没关系，复活了就再干掉你吧！

BOSS 12：外星女王·姐
    战斗要点：姐姐的第1形态比较简单，只要把那些飞碟打散就没有什么危险。在第2形态中，需要先把她脚上的触手干掉，才能攻击她的头部，当她王冠的光芒淡下来后才能对她早成伤害，推荐使用火花进行攻击。

    战斗结束后，游戏也接近尾声了，所有的紫色蘑菇也因为博士的发明而恢复了原状。回到了现在，大家都夸奖了马里奥兄弟们，在最后一场战斗结束后，宝宝们也回到了过去，大家都分开了，但是这份情谊已经烙入了大家的心中。