《生化奇兵》初代剧情

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末日来临                                  {c08}
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         "Ryan takes down smuggling operation...Fontaine
          and thugs killed in fiery shootout!"
                              
                      - Headline, Rapture Standard, 9/12/58

1958年9月12日，Ryan和他的手下，包括警察长Sullivan和总承包商Bill McDonagh，在一场激烈的枪战中，战胜了那只“修补者”（splicer）的军队，消灭了（他们认为是）Fontaine及其手下。然而 Fontaine早就料到了这一天的到来，他制造了一个死亡的假象。战争胜利后，不顾McDonagh的强烈反对，Ryan把Fontaine未来实验室 国有化了，纳入Ryan工业（Ryan Industries）旗下，而不是按照Fontaine的遗愿留给别的人。曾经的Ryan，当政府需要地皮的时候，他可以烧掉自己拥有的小树林，但是现 在的Ryan，背叛了他自己的原则。这件事情成了他事业的一个转折点，也是将来的一系列导致Rapture毁灭的错误决定的开始。

McDonagh从议会里退出了，以表达自己的抗议。Tenenbaum消失了，因为对小妹妹的长期研究，她一直被自己的母性本质困扰着。 Fontaine和Tenenbaum的离开，让Suchong得了便宜，他接受了Ryan提供的工作，因为他是Rapture里唯一一个知道所有关于小 妹妹事情--到现在为止是Fontaine未来实验室最大的秘密--的人。

这时，Fontaine以Atlas的身份再次出现了，一个继承了Fontaine遗愿的**战争英雄。Adam的使用还没有在Rapture广泛流传 开，城市次序也还算良好，但Ryan渐渐的变成了一个独裁者。他雇用了Sander Cohen，一个音乐家也是一个艺术家，在Fort Frolic为自己摇旗呐喊，编写和表演一些宣传片，掩盖他日益腐败的政策。Anna Culpepper，另一个住在Fort Frolic的演员，在公开场合指责Cohen成为了Ryan的走狗，并且写了不少歌曲来抨击Ryan。随着Culpepper和Cohen之间的争斗的 升级，Cohen转向Sullivan寻求帮助。最后，Ryan也介入了，下令Sullivan处决Culpepper。Sullivan执行了，但觉得 非常后悔。当Culpepper在她自己公寓（Mercury Suites apartment）洗澡的时候，Sullivan杀死了她，他从现场带走了一条红黑相间的半编织毛毯作为纪念，用来提醒他自己，那一天，他都做了些什 么。

在这一时期，Ryan犯下的最大的错误可能就是他满足了。他认为他已经完全控制了局面，于是并没有完全摧毁Fontaine的组织，而这时的 Fontaine，正以Atlas的身份干着和以前没有两样的勾当。Atlas直接控制着Rapture的几个区域，其中包括Apollo Square的救济院（poorhouse），而且他一刻不停的招兵买马，为他反击的那一天做着准备。