曾经在N64上推出的知名动作RPG，将化为3D形式重新登场。玩家们要操纵主角林克，逐步解开迷宫中的各式机关。本作中特别加入了利用陀螺仪感应器控制视觉的功能，作为3DS版独特的特色，透过如同摄像机般倾斜主机的方式，便可以自由的移动视角。另外，在本作当中还内含“里塞尔达”关卡。

《塞尔达传说：时之笛3D》内含的“里塞尔达”的洞窟和敌人的设置和通常版稍稍有些不同，总体难度有所上升。原本是作为64DD上的游戏被开发的。本作也可以说是能在一个游戏中玩两个游戏。另外，在“里塞尔达”中还收录了《塞尔达传说：风之韵》的预约特典和任天堂俱乐部的重要交换道具“塞尔达收集”。

近日，任天堂官方更新了本作的发售日期。本作将于6月19日在北美正式发售，6月17日在欧洲正式发售，6月16日在日本正式发售。